Ο φυσικός κύκλος εξωσωματικής γονιμοποίησης απευθύνεται σε γυναίκες που δεν μπορούν ή δεν θέλουν  να υποβληθούν σε διέγερση των ωοθηκών, επίσης σε  γυναίκες που οι ωοθήκες τους  δεν ανταποκρίθηκαν σε προηγούμενη φαρμακευτική διέγερση.

Τέλος, σε γυναίκες με FSH υψηλή ενδεικτικό της περιορισμένης ωοθηκικής απάντησης δεν έχει απολύτως κανένα νόημα η προσθήκη επιπλέον FSH στον οργανισμό με ενέσεις. Ο σκοπός των ενέσεων FSH είναι να ανεβάσουν τα επίπεδα FSH για να δημιουργηθούν περισσότερα του ενός ωοθυλάκια. Ωστόσο, σε αυτές τις γυναίκες τα επίπεδα FSH είναι ήδη ανεβασμένα.

Σε όλες αυτές τις περιπτώσεις ξεκινούμε τη διαδικασία του φυσικού κύκλου οπου εχει αποδειχθεί πολύτιμη καθώε εχει δώσει αρκετές φορές την επιθυμητή λύση